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解旋酶

解旋酶(Helicase)是一类能够利用核苷三磷酸(通常是ATP)水解产生的能量,催化双链核酸(DNA或RNA)解离成单链的酶。它们在DNA复制、修复、重组、转录、RNA剪接和翻译等几乎所有涉及核酸代谢的核心生物学过程中发挥关键作用。解旋酶通过破坏碱基对之间的氢键和碱基堆积作用,沿核酸链定向移动,从而解开双螺旋或核酸-蛋白质复合物。


1. 分类与结构特征

解旋酶可根据其底物特异性、作用方向、寡聚化状态和序列同源性进行分类。

  • 根据底物特异性

    • DNA解旋酶:作用于DNA,如参与复制的DnaB、MCM复合物。

    • RNA解旋酶:作用于RNA,如参与翻译起始的eIF4A。

    • DNA/RNA解旋酶:可作用于两者,如一些参与转录的酶。

  • 根据运动方向(在解开的单链上):

    • 5‘ → 3’ 解旋酶:沿一条链的5‘端向3’端移动。

    • 3‘ → 5’ 解旋酶:沿一条链的3‘端向5’端移动。

  • 根据核心结构域
    绝大多数解旋酶属于超级家族1至6(SF1-SF6),其中SF1和SF2最为常见,通常是单体或二聚体,通过“尺蠖”机制逐步移动。SF3-SF6通常是形成六聚体环状结构的解旋酶(如DnaB、MCM),核酸链穿过其中央孔,进行高效的螺旋解旋。

典型结构特征
解旋酶通常包含保守的核苷酸结合与水解结构域(具有Walker A和Walker B基序),以及与核酸结合的特定结构域。环状六聚体解旋酶具有中央通道,可容纳单链或双链核酸。

2. 作用机制

解旋酶的作用是一个耦合了ATP水解构象变化机械运动的循环过程。

  1. 结合:解旋酶特异性结合到核酸的单链/双链交界处(如复制叉)。

  2. ATP水解与构象变化:结合ATP后,酶发生构象变化,使其对一个或多个碱基对产生作用力。

  3. 链的分离:通过破坏氢键和碱基堆积作用,将双链解开一小段距离(通常每水解1分子ATP解开1-2个碱基对)。

  4. 移位:水解产物(ADP + Pi)释放后,酶恢复到初始构象,并沿其运动方向在核酸链上移动一个碱基的距离,为下一个循环做准备。

  • 逐步机制:常见于SF1/SF2,酶的两个结构域交替与核酸结合,像尺蠖一样爬行。

  • 旋转泵机制:常见于环状六聚体解旋酶(SF3-SF6),其中亚基的构象变化通过中央孔传递,像旋转泵一样将一条链“拉入”并从另一侧“挤出”,实现快速解旋。

3. 主要生物学功能

过程功能描述代表性解旋酶(举例)
DNA复制在复制叉前解开DNA双链,为DNA聚合酶提供单链模板。这是其最经典的功能。DnaB(原核,5‘→3’)、MCM2-7复合物(真核复制起始与延伸核心,3‘→5’)
DNA修复在核苷酸切除修复、碱基切除修复、同源重组等过程中,解开DNA以允许损伤识别、切除或链入侵。XPD(核苷酸切除修复,5‘→3’)、RecQ家族(如BLM、WRN,维持基因组稳定性)
DNA重组催化Holliday连接体的分支迁移,促进遗传交换。RuvB(原核,形成六聚体环推动分支迁移)
转录在RNA聚合酶前方解开DNA双链,或在转录终止时解离RNA-DNA杂交体。Pif1-like 解旋酶、转录延伸因子(如TFIIH中的XPB/XPD)
RNA代谢参与核糖体组装、剪接体解聚、RNA降解、翻译起始等过程,解旋RNA二级结构或RNA-蛋白质复合物。DEAD-box家族(如eIF4A,翻译起始)、Ski2-like(RNA降解)
端粒维持解开端粒DNA的特殊结构(如G-四链体),调节端粒长度。Pif1RTEL1

4. 与疾病的关系

解旋酶功能异常与多种人类疾病密切相关,凸显了其生理重要性。

  • 癌症:RecQ家族解旋酶(如BLM、WRN)突变与布卢姆综合征、维尔纳综合征相关,患者基因组不稳定,癌症易感性显著增高。

  • 遗传性神经疾病:XPD、XPB等转录修复解旋酶突变导致着色性干皮病、科凯恩综合征等,表现为严重的紫外线敏感性、神经退行性变和早衰。

  • 免疫缺陷:与免疫细胞发育相关的解旋酶(如AICDA)突变可导致免疫缺陷。

  • 病毒感染:许多病毒编码自身的解旋酶(如HSV的UL5/UL52/UL8复合物,HCV的NS3)以实现其基因组复制,这些酶是重要的抗病毒药物靶点。


参考文献

  1. Singleton, M. R., Dillingham, M. S., & Wigley, D. B. (2007). Structure and mechanism of helicases and nucleic acid translocasesAnnual Review of Biochemistry, 76, 23-50. (全面综述解旋酶的结构与机制)

  2. Fairman-Williams, M. E., Guenther, U. P., & Jankowsky, E. (2010). SF1 and SF2 helicases: family mattersCurrent Opinion in Structural Biology, 20(3), 313-324. (详述SF1和SF2超级家族)

  3. Croteau, D. L., Popuri, V., Opresko, P. L., & Bohr, V. A. (2014). Human RecQ helicases in DNA repair, recombination, and replicationAnnual Review of Biochemistry, 83, 519-552. (重点阐述RecQ解旋酶在人类基因组维护中的作用)

  4. Syed, S., & Tainer, J. A. (2018). The MCM ring: a DNA helicase and moreCurrent Opinion in Structural Biology, 53, 159-168. (探讨真核复制解旋酶MCM复合物的多功能性)

  5. Jankowsky, E., & Fairman, M. E. (2007). RNA helicases--one fold for many functionsCurrent Opinion in Structural Biology, 17(3), 316-324. (概述RNA解旋酶的多样化功能)

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