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二甲苯蓝

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二甲苯蓝(Xylene Cyanol)编辑本段

1. 化学结构与基本信息编辑本段

  • 学名:二甲苯蓝(Xylene Cyanol FF),属于三苯甲烷类酸性染料

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  • 分子式:C₂₅H₂₇N₂NaO₆S₂ ADSFAEQWER353423413434

  • 结构式核心结构为三苯甲烷骨架,含二甲苯基(-C₆H₃(CH₃)₂)和磺酸基团(-SO₃⁻),钠盐形式增强水溶性。

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  • CAS号:2650-17-1 ADFASDFAF23RQ23R

2. 物理化学性质编辑本段

性质描述
外观蓝绿色结晶粉末
溶解度易溶于水(深蓝色溶液),溶于乙醇乙二醇,不溶于非极性溶剂(如己烷)
吸收可见光区最大吸收波长约610 nm(pH 7.0)
pH指示范围在酸性(黄色)和碱性(蓝色)条件下显色变化,但主要用作电泳示踪剂而非pH指示剂

3. 主要应用编辑本段

(1)电泳示踪剂

  • DNA/RNA电泳:在琼脂凝胶电泳中,与溴酚蓝混合使用,指示电泳迁移进程。 ADSFAEQWER353423413434

  • 迁移率参考:在0.5-2%琼脂糖凝胶中,二甲苯蓝的迁移速率相当于约5000 bp DNA片段

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  • 使用浓度:通常以0.25%的浓度加入上样缓冲液。 ADSFAEQWER353423413434

(2)蛋白质电泳

  • 用于聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE),标记电泳前沿,但应用少于DNA电泳。

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(3)其他用途

  • 色谱分析:作为标记物验证层析柱性能。

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  • 教学实验:演示电泳原理的可见指示剂。 ADFASDFAF23RQ23R

4. 与其他指示剂的对比编辑本段

指示剂迁移速率(琼脂糖凝胶)适用片段大小颜色
溴酚蓝快(约300 bp)<1000 bp蓝色(pH中性
二甲苯蓝慢(约5000 bp)>1000 bp蓝绿色

5. 配制与使用注意事项编辑本段

  • 上样缓冲液配方:6×缓冲液:0.25%二甲苯蓝 + 0.25%溴酚蓝 + 30%甘油(或蔗糖) + 10 mM Tris-HCl(pH 7.6)。

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  • 储存条件:避光干燥保存(室温或4℃),溶液需过滤除菌后分装冻存。 ADFASDFAF23RQ23R

  • 安全操作:避免吸入粉尘,接触皮肤后立即用清水冲洗。 ADSFAEQWER353423413434

6. 替代品与局限性编辑本段

  • 替代品橙G(Orange G):适用于小片段DNA电泳(迁移速率约50 bp)。SYBR系列荧光染料:灵敏度高,但需紫外激发。

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  • 局限性:对高浓度琼脂糖凝胶(>2%)的迁移指示不准确。可能干扰下游测序或酶切反应,需避免在纯化步骤中残留。

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总结编辑本段

二甲苯蓝是分子生物学实验中不可或缺的电泳示踪剂,通过与溴酚蓝联用,可直观判断DNA片段的迁移进度。使用时需根据凝胶浓度选择合适指示剂,并注意其在缓冲液中的兼容性。未来研究可能开发更精准的荧光标记替代品,但目前二甲苯蓝仍因其稳定性和低成本被广泛使用。

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参考资料编辑本段

  • Sambrook, J., & Russell, D. W. (2001). Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3rd ed.). Cold Spring Harbor Laboratory Press.
  • Maniatis, T., Fritsch, E. F., & Sambrook, J. (1982). Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory.
  • Meyers, R. A. (Ed.). (2005). Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine. Wiley-VCH.
  • 张玉静. (2000). 分子生物学实验技术. 北京: 科学出版社.
  • 朱玉贤, 李毅. (2007). 现代分子生物学 (第3版). 北京: 高等教育出版社.
  • 王镜岩, 朱圣庚, 徐长法. (2002). 生物化学 (第3版). 北京: 高等教育出版社.

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