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FRET

FRET(Förster Resonance Energy Transfer)是一种基于能量共振转移的技术,用于研究分子间相互作用、构象变化和距离测量。FRET技术在生物化学、细胞生物学和生物物理学中具有广泛应用。以下是关于FRET的详细信息:


1. **基本原理**

   - **能量转移**:FRET是一种非辐射能量转移现象,当供体荧光团(donor)被激发后,通过偶极-偶极相互作用将能量转移给邻近的受体荧光团(acceptor),导致受体荧光团发光。

   - **距离依赖**:FRET效率(E)与供体和受体之间的距离(r)呈强烈的距离依赖关系,FRET效率与r⁶成反比。当距离在1-10纳米范围内时,FRET最有效。

   - **Förster距离(R₀)**:供体和受体之间的特征距离,在该距离下FRET效率为50%。


2. **FRET效率计算**

  

  • FRET效率(E)可以通过以下公式计算: E=R06R06+r6E = \frac{R_0^6}{R_0^6 + r^6}
  • 或通过供体和受体的荧光强度变化、寿命变化进行测量和计算。

  • 3. **常用FRET对**

       - **荧光蛋白对**:如CFP(青色荧光蛋白)和YFP(黄色荧光蛋白),GFP(绿色荧光蛋白)和RFP(红色荧光蛋白)。

       - **小分子荧光染料对**:如FITC(荧光素异硫氰酸酯)和TRITC(四甲基罗丹明异硫氰酸酯)。


    4. **应用**

       - **分子间相互作用**:FRET用于检测和分析蛋白质-蛋白质、蛋白质-核酸、核酸-核酸之间的相互作用。

       - **构象变化**:通过标记分子的不同部位,研究分子的构象变化和动力学。

       - **距离测量**:测量生物分子间的纳米级距离变化,如受体配体结合、蛋白质复合物组装等。

       - **细胞内过程监测**:实时监测细胞内信号传导、蛋白质定位和动力学变化。


    5. **实验方法**

       - **荧光显微镜**:共聚焦显微镜、宽场荧光显微镜或TIRF显微镜用于FRET检测。

       - **光谱分析**:使用荧光光谱仪测量供体和受体的荧光强度。

       - **荧光寿命成像显微镜(FLIM)**:通过测量供体的荧光寿命变化来计算FRET效率。


    6. **数据分析**

       - **FRET效率(E)**:通过供体和受体的荧光强度变化、荧光寿命变化计算。

       - **FRET比值法**:通过计算受体荧光强度与供体荧光强度的比值,定量分析FRET效率。

       - **FLIM-FRET**:通过供体荧光寿命的变化直接计算FRET效率,提供更加准确的测量。


    7. **优势和局限性**

       - **优势**:FRET可以在活细胞中实时、定量地研究生物分子相互作用,灵敏度高,空间分辨率高。

       - **局限性**:需要精确的荧光标记,荧光团光漂白、光毒性等可能影响实验结果,数据分析复杂。


    8. **示例实验**

       - **蛋白质相互作用研究**:使用CFP标记蛋白A,YFP标记蛋白B,通过FRET检测两者的相互作用。

       - **细胞内钙浓度检测**:利用钙指示器(如Fura-2)的FRET效应,实时监测细胞内钙浓度变化。

       - **构象变化分析**:在蛋白质的两个不同部位标记供体和受体荧光团,通过FRET分析构象变化。


    参考文献:


    1. Lakowicz, J. R. (2006). Principles of Fluorescence Spectroscopy (3rd ed.). Springer.

    2. Förster, T. (1948). Zwischenmolekulare Energiewanderung und Fluoreszenz. Annalen der Physik, 437(1-2), 55-75.

    3. Jares-Erijman, E. A., & Jovin, T. M. (2003). FRET imaging. Nature Biotechnology, 21(11), 1387-1395.

    4. Piston, D. W., & Kremers, G. J. (2007). Fluorescent protein FRET: the good, the bad and the ugly. Trends in Biochemical Sciences, 32(9), 407-414.

    5. Sekar, R. B., & Periasamy, A. (2003). Fluorescence resonance energy transfer (FRET) microscopy imaging of live cell protein localizations. Journal of Cell Biology, 160(5), 629-633.

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