β-转角
β-转角(β-turn)是蛋白质二级结构中的一种常见类型,属于非规则二级结构,主要作用是使蛋白质主链方向发生急剧转折,从而促进蛋白质形成紧凑的三维结构。它常见于连接两个反向β链的区域,并有助于构成抗平行β折叠(antiparallel β-sheet)。
1. 定义与特点
β-转角指蛋白质主链中连续四个氨基酸残基(通常记作i, i+1, i+2, i+3)形成一个急剧的弯曲,使得第i位与第i+3位的α-碳原子(Cα)之间的距离小于7 Å,并常由i和i+3之间形成一个氢键稳定结构。
其主要特征包括:
通常发生在蛋白质表面,便于形成与溶剂的相互作用。
氢键主要形成在i位残基的羰基氧与i+3位残基的氨基氢之间。
通常由小体积或具特殊构象的氨基酸组成,如甘氨酸(Gly)和脯氨酸(Pro)在β-转角中最常见。
2. 分类
根据主链构象(由二面角 φ 和 ψ 值决定),β-转角可分为多种类型,最常见的有以下四类:
类型 | 特点 |
---|---|
Type I | 最常见类型,占所有β-转角的约30%;i+1位多为脯氨酸 |
Type II | i+2位常为甘氨酸,避免空间排斥 |
Type I′ | Type I 的镜像型 |
Type II′ | Type II 的镜像型 |
此外还有Type VI、Type VIII等少见类型。
3. 生物学功能
连接结构单元:β-转角常出现在两个次级结构单元(如β链、α螺旋)之间,构成环路或回转结构。
促进蛋白折叠:转角使肽链紧凑折叠,有助于蛋白质形成球状结构。
参与识别与结合:由于β-转角多位于蛋白质表面,常参与分子识别、受体结合等功能区域的形成。
4. 实例
在免疫球蛋白结构域、蛋白激酶、酶活性位点周围等常见β-转角;此外,某些小蛋白如β-发夹(β-hairpin)就是由两个反向β链通过一个β-转角连接而成的典型结构。
5. 与其他结构的比较
与α螺旋或β-折叠不同,β-转角结构更短小、局部、灵活。
与**环区(loop)**类似,β-转角也属于非规则结构,但其构象和氢键形成更具规律性。
β-转角是蛋白质构象中不可忽视的组成部分,在维持结构完整性与功能活性中发挥重要作用。
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