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α螺旋

α-螺旋(α-helix) 是蛋白质二级结构中最常见的构象之一,由Linus Pauling于1951年首次提出,其稳定性和周期性对蛋白质功能至关重要。以下是系统性解析:


🔬 一、结构特征

  1. 基本形态

    • 多肽链围绕中心轴右手螺旋上升(天然蛋白中占比>90%),每圈含 3.6 个氨基酸残基

    • 螺距(螺旋一圈的高度)为 5.4 Å,残基间轴向距离 1.5 Å

    • 侧链(R基团)向外辐射伸展,避免空间位阻。

  2. 氢键维系系统

    • 关键驱动力:主链羰基氧(C=O)下游第4个残基的氨基氢(N-H) 形成氢键(表示为 C=OHN\ce{C=O} \cdots \ce{H-N})。

    • 氢键方向平行于螺旋轴,形成连续环状网络(见下图)。

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      残基n:  -N-H          (氢键供体)
               |
      残基n+4: O=C-         (氢键受体)

📏 二、关键参数与影响因素

参数数值生物学意义
螺旋圈数3.6残基/圈最大化氢键且避免空间冲突
氢键长度2.8–3.0 Å接近理想范德华距离,稳定性高
φ/ψ二面角φ≈-57°, ψ≈-47°拉氏构象图中α-螺旋区核心位置
螺旋倾向性Ala>Glu>Leu>Met>Lys小侧链(Ala)利于紧密盘绕
螺旋破坏者Pro(刚性亚胺环)、Gly(过柔)中断氢键网络或增加构象熵

💡 螺旋轮(Helical Wheel):将α-螺旋投影为平面圆盘,可分析两亲性(如疏水面朝向分子内部)。


⚙️ 三、生物学功能

  1. 结构支架

    • 角蛋白(毛发、指甲):富含Ala、Leu、Cys,通过二硫键交联形成超螺旋。

    • 肌球蛋白/原肌球蛋白:长α-螺旋作为肌肉收缩的刚性杆状域。

  2. 功能活性位点

    • DNA结合蛋白(如亮氨酸拉链):螺旋一侧带正电荷残基(Arg/Lys)结合DNA磷酸骨架。

    • 跨膜通道:疏水α-螺旋(如细菌视紫红质)在脂双层中形成离子通道。

  3. 构象变化枢纽

    • G蛋白偶联受体(GPCR):7次跨膜α-螺旋将信号从胞外传递至胞内。


⚠️ 四、特殊类型与变异

类型特征实例
3₁₀-螺旋3.0残基/圈,氢键在n→n+3,稳定性较低蛋白质末端或转角区
π-螺旋4.4残基/圈,罕见(<0.1%)某些酶活性中心
左手α-螺旋理论存在,但天然蛋白中极不稳定人工多肽可短暂形成
两亲性螺旋一侧亲水、一侧疏水载脂蛋白A-I(脂质结合关键)

🧪 五、实验鉴定方法

  1. 圆二色谱(CD)

    • 典型信号:222 nm(n→π⁺跃迁)208 nm/190 nm(π→π⁺跃迁) 负峰。

  2. X射线晶体学

    • 电子密度图显示连续圆柱状电子云。

  3. 核磁共振(NMR)

    • 观测主链二面角(φ/ψ)分布及氢键耦合常数。


💎 总结

α-螺旋作为蛋白质折叠的基础模块

  • 稳定性:依赖周期性氢键网络和适宜残基(Ala/Glu)。

  • 功能性:兼具机械强度(角蛋白)与动态信号传导(GPCR)。

  • 可预测性:通过Chou-Fasman算法或深度学习(AlphaFold)可高精度预测其位置。

🌟 延伸思考:α-螺旋的规律性启发了人工蛋白设计(如螺旋束纳米孔),在合成生物学中具有广阔应用前景。

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