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生物钟转录翻译反馈环

一、概述

生物转录翻译反馈环的发现始于1971年Konopka和Benzer筛选到果蝇period(per)突变体,1990年Hardin等提出转录翻译负反馈模型,2000年后哺乳动物核心基因陆续克隆。该机制具有三个本质特征:内源性(持续条件下保持约24小时周期)、可牵引性(光温等环境信号可重设相位)、温度补偿性(周期随温度变化较小)。从蓝藻人类,TTFL机制高度保守但分子组件存在进化差异,体现了昼夜节律生命生存的根本重要性。

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二、生理机制

哺乳动物核心TTFL由正臂负臂构成。

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  • 正臂:CLOCK(或NPAS2)与BMAL1形成bHLH-PAS结构域异二聚体,结合靶基因启动子的E-box(CACGTG)序列,激活Per1/2/3、Cry1/2等钟基因及数千个钟控基因(CCG)的转录。
  • 负臂:PER和CRY蛋白在胞质积累并磷酸化,形成多聚复合物后入核,直接结合CLOCK/BMAL1抑制其转录活性,关闭自身基因表达。PER/CRY蛋白经泛素化降解后,抑制解除,新一轮转录开始。

辅助环路增强节律稳健性:REV-ERBα/β和RORα/β竞争性结合Bmal1启动子的RORE元件,分别抑制和激活Bmal1转录,形成第二重反馈。翻译后修饰精确调控周期:CKIδ/ε磷酸化PER蛋白调控其稳定性和核转运;FBXL3等E3连接酶介导CRY泛素化降解;SIRT1通过去乙酰化连接代谢状态与时钟功能。全基因组研究显示约43%的蛋白编码基因在至少一个组织中呈现节律性表达。

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三、功能意义

TTFL机制的进化意义在于使生物体能够预测环境的昼夜变化,提前准备生理活动。细胞自主的时钟同步代谢通路节律:糖异生脂肪酸氧化、解毒酶表达均呈现昼夜波动,优化能量利用效率。系统层面,下丘交叉上核(SCN)的主时钟通过神经体液通路同步外周组织时钟,协调睡眠-觉醒、进食-禁食、激素分泌等行为和生理节律。生殖系统中,时钟调控排卵前LH峰的精确时间窗;免疫系统中,时钟调控炎症因子释放免疫细胞trafficking。该机制紊乱导致代谢综合征睡眠障碍肿瘤风险增加,凸显其生理重要性。

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四、研究进展

近年发现非转录依赖的生物钟机制,如过氧化物氧还蛋白的氧化还原振荡红细胞无核细胞中维持节律,提示TTFL与代谢振荡耦合。ChIP-seq技术绘制了全基因组水平的钟蛋白结合图谱,揭示了时钟对转录组表观基因组三维基因组的多层级调控。时间药理学研究证实药物疗效和毒性具有昼夜节律性,按生物钟给药可显著提高治疗指数。时钟重编程技术通过小分子化合物调控TTFL,为时差综合征、轮班工作障碍、代谢疾病提供了新的治疗策略。

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插图

图注:哺乳动物生物钟核心转录翻译反馈环。CLOCK/BMAL1正调控复合物激活PER/CRY表达,后者积累后入核负反馈抑制自身转录;REV-ERB/ROR辅助环路调控Bmal1转录;翻译后修饰(磷酸化、泛素化等)精细调节周期时长。

图注:哺乳动物生物钟核心转录翻译反馈环。CLOCK/BMAL1正调控复合物激活PER/CRY表达,后者积累后入核负反馈抑制自身转录;REV-ERB/ROR辅助环路调控Bmal1转录;翻译后修饰(磷酸化、泛素化等)精细调节周期时长。 ADFASDFAF23RQ23R

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参考文献

[1].   Koike N, Yoo SH, Huang HC, et al. Transcriptional architecture and chromatin landscape of the core circadian clock in mammals. Science, 2012, 338 (6105): 349-354.
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[3].   Panda S, Antoch MP, Miller BH, et al. Coordinated transcription of key pathways in the mouse by the circadian clock. Cell, 2002, 109 (3): 307-320.

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