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重复序列

 

英文名称

重复序列 repetitive sequence

介绍


     真核生物基因组相当于基因的一股由只有一个复制DNA序列(也称单一DNA,unique sequence,single copy seqence,nonrepetitive sequence等)和具有多数反复存在的DNA顺序组成。称后者为重复顺序。组成基因组的DNA顺序,根据其重复的频度可分为三类。一是基因组只有一个复制顺序的单一DNA,二为高度重复顺序(highly repetitivesequence),由较短的顺序105—107次直线连结而成,其中含随体DNA等。第三为中等程度的重复顺序(moderately repetitive sequence),为有300—500个核苷对的大致相同的顺序——例如在将哺乳类的DNA用限制酶AluI(AG↓CT)切断时所产主的主要片断中所见到的高频率(105)的顺序(AluIfamily)——与单一DNA一起分散存在的,以及像核糖体RNA基因或组蛋白基因群那样的多次成直线相连存在的(多基因群)都包含在这一类中。此外有在反方向上重复的顺序(inverted repetitive seq-uence),其变性DNA折叠成发夹结构(hairpinstructure,foldback structure,snapback stru-cture),在编码分析中可迅速再结合的类型。

        染色体上存在的大量无转录活性的重复DNA序列。其组织形式有两种:串联重复序列;分散重复序列。前一种成簇存在于染色体的特定区域,后一种分散于染色体的各位点上。目前对于重复序列的作用还不是十分清楚。

        大体可分成3大类。(1)高度重复序列:重复几百万次,一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段。如异染色质上的卫星DNA。它们是不翻译的片段。在小鼠中约占基因组的10%。(2)中度重复序列:重复次数为几十次到几千次。在小鼠中约占20%。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。(3)单一序列:在整个基因组中只出现一次或少数几次的序列,在小鼠中约占基因组的70%。如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、丝心蛋白基因等。实验证明,所有真核生物染色体可能均含重复序列而原核生物一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随真核生物物种的不同而变化。

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