重复序列
概述编辑本段
真核生物的基因组由单一DNA序列(unique sequence, single copy sequence, nonrepetitive sequence)和重复序列(repetitive sequence)组成。重复序列是具有多个拷贝的DNA顺序,根据重复频度可分类为三类:高度重复序列、中度重复序列和单一序列。 ADSFAEQWER353423413434
分类编辑本段
1. 高度重复序列
高度重复序列(highly repetitive sequence)由较短的顺序(通常少于10个核苷酸残基)以105-107次直线连结而成,例如卫星DNA(satellite DNA)。此类序列位于异染色质上,无转录活性,在小鼠中约占基因组的10%。它们是未翻译的片段。
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2. 中度重复序列
中度重复序列(moderately repetitive sequence)重复次数为几十次到几千次,在小鼠中约占20%。例如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。此外,限制酶AluI(AG↓CT)切割哺乳类DNA时产生的主要片段中可见高频率(105)的Alu家族序列,亦属于此类。重组序列可成串联排列(如多基因群)或与单一DNA分散存在。 ADFASDFAF23RQ23R
3. 单一序列
单一序列在整个基因组中只出现一次或少数几次,在小鼠中约占基因组的70%。例如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、丝心蛋白基因等。实验证明,所有真核生物染色体均含重复序列,而原核生物一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随真核生物物种的不同而变化。 ADSFAEQWER353423413434
组织形式编辑本段
反向重复序列编辑本段
存在反向重复的顺序(inverted repetitive sequence),其变性DNA可折叠成发夹结构(hairpin structure, foldback structure, snapback structure),在编码分析中可迅速再结合。
分类对比表编辑本段
| 类型 | 重复次数 | 片段长度 | 示例 | 占基因组比例(小鼠) |
|---|---|---|---|---|
| 高度重复序列 | 105-107 | 通常<10 nt | 卫星DNA | ~10% |
| 中度重复序列 | 数十至数千 | ~300-500 bp | rRNA基因、tRNA基因、组蛋白基因、Alu家族 | ~20% |
| 单一序列 | 1或少数 | 可变 | 珠蛋白基因、卵清蛋白基因 | ~70% |
目前对于重复序列的作用还不是十分清楚。 ADSFAEQWER353423413434
参考资料编辑本段
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