生物行•生命百科  > 所属分类  >  分子生物学   

类泛素化修饰

目录

概述编辑本段

Small Ubiquitin-like Modifier(SUMO)蛋白是一类小分子蛋白家族成员,共价地附接在其他细胞蛋白以修改它们的功能。SUMO化翻译后修饰,参与各种细胞过程,例如核-细胞质运输,转录调节细胞凋亡蛋白质稳定性,应激反应,和细胞周期ADFASDFAF23RQ23R

结构与亚型编辑本段

SUMO蛋白类似泛素,被认为是泛素样蛋白家族的成员。SUM O蛋白很小,大多数约100个氨基酸长度,12 kDa质量。尽管SUMO在氨基酸水平上与泛素序列同一性小于20%,但其结构折叠几乎相同。SUMO蛋白具有独特的10-25个氨基酸N端延伸,与其他类泛素蛋白不同。该N端与SUMO链的形成有关。人SUMO1是球状蛋白,由α螺旋和β片组成,基于NMR分析。

ADFASDFAF23RQ23R

人类有4种确认的SUMO亚型:SUMO-1,SUMO-2,SUMO-3和SUMO-4。在氨基酸水平上,SUMO1与几乎相同的SUMO2/3约有50%相同。SUMO-2/3彼此高度相似,与SUMO-1不同。SUMO-4在90位有脯氨酸而非谷氨酰胺,正常条件下不进行加工和缀合,但在应激饥饿条件下修饰蛋白质。在有丝分裂期间,SUMO-2/3定位于着丝粒和浓缩染色体,而SUMO-1定位于有丝分裂纺锤体和中间区,表明SUMO旁系同源物调节不同有丝分裂过程。SUMO-2/3修饰参与应激反应,并能形成混合链,由于SUMO-1缺少内部SUMO共有位点,可终止多SUMO链。SUMO-1的丝氨酸2被磷酸化,提出“修饰修饰物”概念。

ADFASDFAF23RQ23R

功能编辑本段

蛋白质的SUMO修饰具有多种功能,包括蛋白质稳定性、核-胞质转运和转录调控。靶蛋白的SUMO化影响定位和结合伴侣。RanGAP1的SUMO-1修饰导致其从胞浆转运到核孔复合体。hNinein的SUMO修饰导致其从中心体核心释放。在许多情况下,转录调节子的SUMO修饰与转录抑制相关。 ADSFAEQWER353423413434

DNA损伤反应编辑本段

细胞DNA暴露于破坏剂时,SUMO蛋白作为分子胶促进修复灶中蛋白复合物组装,改变蛋白质的生化活性和相互作用。SUMO化在碱基切除修复核苷酸切除修复、非同源末端连接同源重组修复中起作用,还参与跨损伤合成。

ADFASDFAF23RQ23R

SUMO化过程编辑本段

SUMO化由类似泛素化的酶级联反应介导。SUMO前体经SENP蛋白酶切割C端肽,暴露二甘氨酸基序。成熟的SUMO与E1激活酶(SAE)结合,传递至E2结合酶(Ubc9),最后E3连接酶(如PIAS、Mms21、RanBP2)附着到底物蛋白。E2在存在共有序列时足够,E3促进效率并引导至非共有基序。在酵母中有四种SUMO E3蛋白:Cst9, Mms21, Siz1, Siz2。SUMO化可逆,由SENP蛋白酶去除。

ADSFAEQWER353423413434

SUMO预测编辑本段

大多数SUMO修饰蛋白包含四肽共有基序Ψ-KxD/E(Ψ疏水残基,K赖氨酸,x任意氨基酸,D/E酸性残基)。预测程序包括: ADSFAEQWER353423413434

  • SUMOplot:在线免费,基于SUMO-CS评分,考虑氨基酸匹配和疏水性替代。
  • seeSUMO:使用随机森林和支持向量机训练。
  • SUMOsp:使用PSSM评分潜在位点,包括非规范基序。
  • JASSA:预测经典和反向共识SUMO化位点及SUMO交互基序(SIM),基于位置频率矩阵,集成二级结构和3D折叠信息

DeSUMOylation编辑本段

SUMO可通过特异性蛋白酶(人SENP或酵母Ulp1/Ulp2)从底物去除。

ADSFAEQWER353423413434

在蛋白质纯化中的作用编辑本段

大肠杆菌表达的重组蛋白常形成包涵体。将目标蛋白与SUMO标签融合可增加可溶性,再用SUMO特异性蛋白酶(如Ulp1)切割标签纯化。 ADSFAEQWER353423413434

参考资料编辑本段

  • Hay RT. SUMO: a history of modification. Mol Cell. 2005;18(1):1-12.
  • Johnson ES. Protein modification by SUMO. Annu Rev Biochem. 2004;73:355-382.
  • Geiss-Friedlander R, Melchior F. Concepts in sumoylation: a decade on. Nat Rev Mol Cell Biol. 2007;8(12):947-956.
  • Flotho A, Melchior F. Sumoylation: a regulatory protein modification in health and disease. Annu Rev Biochem. 2013;82:357-385.
  • 张磊, 李霞. SUMO化修饰在DNA损伤修复中的作用. 生物化学生物物理进展. 2010;37(8):827-834.
  • 王颖, 赵永芳. 类泛素化修饰SUMOylation的研究进展. 中国细胞生物学学报. 2015;37(3):413-420.

附件列表


15

词条内容仅供参考,如果您需要解决具体问题
(尤其在法律、医学等领域),建议您咨询相关领域专业人士。

如果您认为本词条还有待完善,请 编辑

上一篇 核苷酸序列    下一篇 长链非编码RNA