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ADP核糖化

ADP核糖化(ADP-ribosylation)是一种重要的翻译后修饰,通过将ADP-核糖基团从NAD⁺分子转移到靶蛋白的特定位点上,调控蛋白质的功能、相互作用、定位和稳定性。ADP核糖化在DNA修复、基因表达调控、细胞凋亡和应激反应中发挥关键作用。以下是关于ADP核糖化的详细信息:


1. **基本概念**

   - **ADP-核糖基团**:由一分子ADP和一个核糖分子组成,从NAD⁺(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)中转移。

   - **酶**:由ADP-核糖基转移酶(ADP-ribosyltransferases, ARTs)催化,分为两类:单ADP-核糖基转移酶(mono-ADP-ribosyltransferases, mARTs)和多ADP-核糖基转移酶(poly-ADP-ribosyltransferases, pARTs)。


2. **ADP核糖化过程**

   - **单ADP核糖化(Mono-ADP-ribosylation)**:一个ADP-核糖基团转移到靶蛋白的特定位点(如精氨酸、赖氨酸、天冬氨酸或谷氨酸)。

   - **多ADP核糖化(Poly-ADP-ribosylation)**:多个ADP-核糖基团通过糖苷键相互连接,形成多聚ADP-核糖链,附着在靶蛋白上。


3. **功能与机制**

   - **DNA修复**:PARP(聚ADP-核糖聚合酶)家族中的PARP1在DNA单链断裂修复中起关键作用,识别DNA损伤并通过ADP核糖化招募修复蛋白。

   - **基因表达调控**:ADP核糖化调控转录因子和转录调控因子的活性,影响基因表达。

   - **细胞应激反应**:ADP核糖化在细胞应对氧化应激、热休克等应激条件中起重要作用。

   - **细胞凋亡**:ADP核糖化参与细胞凋亡信号传导,调控凋亡相关蛋白的功能。


4. **研究方法**

   - **Western Blot**:使用ADP-核糖特异性抗体检测ADP核糖化蛋白。

   - **免疫共沉淀(Co-IP)**:研究ADP核糖化蛋白与其他蛋白的相互作用。

   - **质谱分析(Mass Spectrometry)**:鉴定和定量分析ADP核糖化位点和修饰模式。

   - **蛋白质组学**:系统分析细胞或组织中ADP核糖化蛋白质及其动态变化。


5. **临床相关**

   - **癌症**:PARP1在DNA修复中的关键作用使其成为抗癌治疗的靶点,PARP抑制剂(如奥拉帕尼)用于治疗BRCA突变相关的乳腺癌和卵巢癌。

   - **神经退行性疾病**:ADP核糖化在神经元损伤和神经退行性疾病(如帕金森病、阿尔茨海默病)中发挥重要作用。

   - **心血管疾病**:ADP核糖化参与心肌缺血再灌注损伤和心脏病的病理过程。


6. **药物开发**

   - **PARP抑制剂**:靶向PARP酶的抑制剂用于治疗癌症,阻断DNA修复通路,增加癌细胞的凋亡。

   - **小分子干扰剂**:开发特定ADP-核糖基转移酶或去ADP-核糖化酶的抑制剂,调控ADP核糖化状态,用于疾病治疗。


7. **例子**

   - **PARP1**:在DNA损伤应答和修复中起关键作用,通过多聚ADP核糖化修饰招募DNA修复蛋白。

   - **SIRT6**:具有去ADP-核糖化酶活性,调控基因表达和代谢。


参考文献:


1. Hottiger, M. O., Hassa, P. O., Lüscher, B., Schüler, H., & Koch-Nolte, F. (2010). Toward a unified nomenclature for mammalian ADP-ribosyltransferases. Trends in Biochemical Sciences, 35(4), 208-219.

2. Schreiber, V., Dantzer, F., Amé, J. C., & de Murcia, G. (2006). Poly(ADP-ribose): novel functions for an old molecule. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 7(7), 517-528.

3. Pascal, J. M., & Ellenberger, T. (2015). The rise and fall of poly(ADP-ribose): an enzymatic perspective. DNA Repair, 32, 10-16.

4. Luo, X., & Kraus, W. L. (2012). On PAR with PARP: cellular stress signaling through poly(ADP-ribose) and PARP-1. Genes & Development, 26(5), 417-432.

5. Gibson, B. A., & Kraus, W. L. (2012). New insights into the molecular and cellular functions of poly(ADP-ribose) and PARPs. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 13(7), 411-424.

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