外显子捕捉

外显子捕捉（Exome Capture）是一种基因组学技术，用于富集和测序基因组中的外显子区域。外显子是基因组中编码蛋白质的部分，虽然只占整个基因组的约1-2%，但却包含了大多数已知的与疾病相关的遗传变异。外显子捕捉技术通过特异性捕获这些外显子区域，使得研究人员能够高效地研究这些区域的遗传变异。

技术原理

外显子捕捉技术通常使用特异性探针来捕获目标外显子区域。这些探针可以是基于DNA或RNA的寡核苷酸，能够与外显子区域特异性结合。捕获后的外显子区域随后通过高通量测序技术进行测序。常用的外显子捕捉平台包括Agilent SureSelect、Illumina TruSeq Exome和Roche NimbleGen SeqCap EZ等。

应用

外显子捕捉技术在医学研究和临床诊断中有广泛应用。它被用于识别与遗传疾病相关的突变，研究复杂疾病的遗传基础，以及进行癌症基因组学分析。由于外显子捕捉技术能够高效地富集和测序外显子区域，因此它在成本和时间上比全基因组测序更具优势。

优缺点

优点：

• 高效性：外显子捕捉技术能够高效地富集和测序外显子区域，使得研究人员能够集中资源研究这些功能性区域。

• 成本效益：与全基因组测序相比，外显子捕捉技术的成本较低，适合大规模研究。

• 数据解读：由于外显子区域的功能注释较为完善，数据解读相对容易。

缺点：

• 覆盖范围有限：外显子捕捉技术只能覆盖外显子区域，无法检测非编码区域的变异。

• 技术偏差：捕获效率和均匀性可能存在技术偏差，影响测序结果的准确性。

参考文献

1. Ng, S. B., et al. (2009). "Targeted capture and massively parallel sequencing of 12 human exomes." Nature, 461(7261), 272-276. doi:10.1038/nature08250

2. Bamshad, M. J., et al. (2011). "Exome sequencing as a tool for Mendelian disease gene discovery." Nature Reviews Genetics, 12(11), 745-755. doi:10.1038/nrg3031

3. Ku, C. S., et al. (2012). "Exome sequencing: dual role as a discovery and diagnostic tool." Annals of Neurology, 71(1), 5-14. doi:10.1002/ana.22647