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环状 RNA
一、 生物发生与分类
生物发生机制:
- 外显子反向剪接: 下游外显子的 5' 剪接位点与上游外显子的 3' 剪接位点连接, 形成外显子环状 RNA
- 内含子环化: 内含子在剪接过程中形成环状结构, 称为内含子环状 RNA
- 外显子 - 内含子环状 RNA: 同时包含外显子和内含子序列
分类:
- 外显子环状 RNA(ecircRNA): 最常见的类型, 位于细胞质中
- 内含子环状 RNA(ciRNA): 位于细胞核中
- 外显子 - 内含子环状 RNA(EIciRNA): 位于细胞核中
二、 结构与特性
- 共价闭合环状结构: 没有游离的 5' 和 3' 末端, 不易被核酸外切酶降解
- 高稳定性: 半衰期通常超过 48 小时, 远长于线性 mRNA
- 组织特异性和发育阶段特异性: 在不同组织和发育阶段的表达模式不同
- 高丰度: 部分 circRNA 的表达水平远高于其对应的线性 mRNA
三、 主要生物学功能
- miRNA 海绵: 通过多个 miRNA 结合位点吸附 miRNA, 抑制 miRNA 对靶基因的调控
- 蛋白质结合: 结合 RNA 结合蛋白, 调控蛋白质的功能和定位
- 转录调控: EIciRNA 和 ciRNA 位于细胞核中, 调控亲本基因的转录
- 剪接调控: 通过与线性 mRNA 竞争剪接位点, 调控可变剪接
- 翻译功能: 部分 circRNA 含有内部核糖体进入位点(IRES), 可翻译产生小肽
四、 疾病关联与应用
- 肿瘤: circRNA 在多种肿瘤中异常表达, 作为癌基因或抑癌基因发挥功能
- 神经退行性疾病: circRNA 在大脑中高表达, 其异常与阿尔茨海默病、 帕金森病密切相关
- 心血管疾病: circRNA 参与心肌梗死、 心力衰竭等心血管疾病的发病过程
- 临床应用:
- 作为疾病诊断和预后评估的生物标志物
- 作为疾病治疗的靶点, 通过过表达或敲低 circRNA 治疗疾病
环状 RNA 的生物发生机制与生物学功能示意图 的图像结果