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体外转录

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定义编辑本段

体外转录(In vitro transcription)是指在试管或反应管中,使用RNA聚合酶以模板DNA为蓝本合成RNA分子的过程,模拟细胞内的RNA合成,但在细胞外环境中进行。该方法广泛应用于RNA探针制备、mRNA疫苗核糖体显示、RNA结构功能研究、体外翻译体系及CRISPR系统的gRNA合成生物医学领域

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原理与关键要素编辑本段

体外转录系统由下列基本组分构成:

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  • DNA模板:通常为线性化的质粒PCR产物,须包含启动子序列(如T7、T3或SP6);
  • RNA聚合酶:来源于噬菌体,如T7 RNA polymerase,专一识别其启动子;
  • NTPs(ATP, CTP, GTP, UTP):转录反应的基本原料;
  • 缓冲液体系:包括Tris-HCl、Mg²⁺、DTT等,维持酶活性和离子环境;
  • 酶抑制剂:如RNase inhibitor,防止RNA降解。

标准反应步骤包括:

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  • 模板DNA与反应组分混合;
  • 恒温反应(一般为37°C,1–4小时);
  • 反应后可用DNase I消化模板DNA;
  • 纯化RNA产物(如酚/氯仿抽提、柱纯化或LiCl沉淀)。

常用启动子与聚合酶编辑本段

聚合酶启动子序列(5'→3')
T7 RNA polymeraseTAATACGACTCACTATA
SP6 RNA polymeraseATTTAGGTGACACTATA
T3 RNA polymeraseAATTAACCCTCACTAAA

这些聚合酶专一识别其启动子,不会在其他序列上启动转录。 ADFASDFAF23RQ23R

应用编辑本段

  • RNA探针制备:用于Northern blot、in situ杂交核酸芯片;
  • 体外翻译模板:为无细胞翻译系统(如小鼠胚胎提取物)提供mRNA模板;
  • mRNA疫苗:如新冠疫苗BNT162b2和mRNA-1273均采用体外转录合成mRNA;
  • gRNA合成CRISPR-Cas9系统中常以体外转录合成向导RNA;
  • RNA功能研究:结构分析、RNA剪接核酶实验等。

注意事项编辑本段

  • DNA模板必须无污染且完全线性化,否则易形成非特异产物;
  • RNA极易被降解,实验器具需彻底去除RNase污染;
  • 使用DEPC处理水和管材,并配合RNase抑制剂;
  • 片段RNA建议进行RNA电泳验证完整性。

参考资料编辑本段

  • Milligan JF, Groebe DR, Witherell GW, Uhlenbeck OC. Oligoribonucleotide synthesis using T7 RNA polymerase and synthetic DNA templates. Nucleic Acids Res. 1987.
  • Beckert B, Masquida B. Synthesis of RNA by in vitro transcription. Methods Mol Biol. 2011.
  • Karikó K et al. In vitro-transcribed mRNA: past, present, and future. Mol Ther. 2011.
  • Krieg PA, Melton DA. Functional messenger RNAs are produced by SP6 in vitro transcription of cloned cDNAs. Nucleic Acids Res. 1984.
  • Sousa R, Mukherjee S. T7 RNA polymerase. Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 2003.
  • 魏晓东, 张弛. 体外转录技术在mRNA疫苗研发中的应用. 中国生物工程杂志. 2021.
  • 王晓燕, 李慧. 体外转录合成RNA探针的技术要点及应用. 生物技术通报. 2019.

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