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溶质载体超家族

SLC - 溶质载体超家族(solute carrier family, SLC)是一组膜转运蛋白,包括400多个成员,其中大部分位于细胞膜中。它们的主要功能是促进各种底物跨生物膜的运输,包括将小分子吸收到细胞中。溶质载体的 SLC 超家族是仅次于 G 蛋白偶联受体的第二大膜蛋白家族。在超家族内部,结构千差万别,但它们的功能却是统一的。基于序列相似性已经确定了 50 多个家族,但其中许多家族在它们携带的溶质方面重叠。两个家族(SLC3 和 SLC7)仅生成功能性转运蛋白作为异聚体伙伴,其中一个伙伴是单个跨膜结构域蛋白。在功能上,成员可以分为依赖于离子梯度(特别是钠、氯或质子)、溶质交换或简单平衡门控的成员。对于许多成员来说,运输的化学计量尚未确定。一个转运蛋白家族也具有酶活性(SLC27),溶质载体膜转运蛋白膜转运蛋白广泛表达于全身,主要器官的上皮细胞,如肝、肠、肾和具有屏障功能的器官,如脑、睾丸和胎盘。不同的转运蛋白定位于质膜以及各种亚细胞器的膜。由于所需底物的调节传递,这维持了细胞稳态。因此,SLC 转运蛋白在从细胞吸收营养物质到吸收药物和其他外源性物质的生理过程中发挥着重要作用。
目录

范围 编辑本段

按照命名系统的惯例,单个 SLC 家族中的成员彼此之间具有超过 20-25% 的序列同一性。相比之下,SLC 家族之间的同源性非常低甚至不存在。因此,将一个家族纳入 SLC 组的标准不是与其他 SLC 家族的进化相关性,而是功能性(即运输溶质的完整膜蛋白)。 SLC 组包括以下转运蛋白的示例:促进性转运蛋白(允许溶质以其电化学梯度向下流动) 次级活性转运蛋白(允许溶质逆着电化学梯度向上流动,通过耦合到第二个溶质的转运,第二个溶质以其梯度向下流动,这样总体自由能变化仍然是有利的) SLC 系列不包括先前已被其他广泛接受的命名系统分类的转运蛋白家族成员,包括: 初级主动转运蛋白(允许逆电化学梯度向上流动),例如 ABC(ATP 结合盒)转运蛋白,通过将转运耦合到能量释放事件,例如 ATP 水解离子通道水通道蛋白(水通道)主要主动转运蛋白(允许逆电化学梯度向上流动),例如 ABC(ATP 结合盒)转运蛋白,通过将转运与能量释放事件(例如 ATP 水解离子通道)水通道蛋白(水通道)耦合主要主动转运蛋白(允许逆电化学梯度向上流动),例如 ABC(ATP 结合盒)转运蛋白,通过将转运与能量释放事件(例如 ATP 水解离子通道)水通道蛋白(水通道)耦合主要主动转运蛋白(允许逆电化学梯度向上流动),例如 ABC(ATP 结合盒)转运蛋白,通过将转运与能量释放事件(例如 ATP 水解离子通道)水通道蛋白(水通道)耦合主要主动转运蛋白(允许逆电化学梯度向上流动),例如 ABC(ATP 结合盒)转运蛋白,通过将转运与能量释放事件(例如 ATP 水解离子通道)水通道蛋白(水通道)耦合 

亚细胞分布编辑本段

 SLC 组的大多数成员位于细胞膜中,但也有一些成员位于线粒体(最著名的是 SLC 家族 25)或其他细胞内细胞器中。 

命名系统 编辑本段

单个 SLC 成员的名称具有以下格式: SLCnXm 其中:SLC 是根名称 (SoLute Carrier) n 代表家族的整数(例如,1-52) X 单个字母(A、B、C、...)表示a subfamily m 代表单个家族成员(同种型)的整数。例如,SLC1A1 是 SLC 家族 1 的亚家族 A 的第一个同种型。 SLC 家族 21(有机阴离子转运多肽转运蛋白)出现异常,这是由于历史原因具有格式为 SLCOnXm 的名称,其中 n 家族编号、X 亚家族字母和 m 成员编号。虽然 HGNC 只为人类基因指定命名法,但按照惯例,这些基因的脊椎动物直向同源物采用相同的命名法(例如,VGNC 指定的 SLC10A1 直向同源物)。对于啮齿动物,符号的大小写与其他脊椎动物的不同之处在于使用标题大小写,即Slc1a1 表示人类 SLC1A1 基因的啮齿动物直向同源物。 

家族编辑本段

 以下家族在 SLC 下命名:
高亲和力谷氨酸和中性氨基酸转运蛋白(SLC1A1、SLC1A2、SLC1A3、SLC1A4、SLC1A5、SLC1A6、SLC1A7)
促进性 GLUT 转运蛋白(SLC2A1、SLC2A2、SLC2A4、SLCA2、SLCA2、SLCA2 SLC2A8, SLC2A9, SLC2A10, SLC2A11, SLC2A12, SLC2A13, SLC2A14) 
异二聚氨基酸转运蛋白重亚基(SLC3A1, SLC3A2)
碳酸氢盐转运蛋白(SLC4A1, SLC4A2, SLC4A4, SLCA4, SLCA4, SLCA4, SLCA4, SLCA4, SLCA4, SLCA4 ) 
钠葡萄糖协同转运蛋白 (SLC5A1, SLC5A2, SLC5A3, SLC5A4, SLC5A5, SLC5A6, SLC5A7, SLC5A8, SLC5A9, SLC5A10, SLC5A11, SLC5A12) 
钠和氯依赖钠:神经转运蛋白,SLC6A,SLC6A,SLC6A,SLC6A,SLC6symitter SLC6A6、SLC6A7、SLC6A8、SLC6A9、SLC6A10、SLC6A11、SLC6A12、SLC6A13、SLC6A14、SLC6A15、SLC6A16、SLC6A17、SLC6A18、SLC6A19、SLC6A20) 
阳离子氨基酸转运蛋白/糖蛋白相关的阳离子氨基酸转运蛋白 (SLC7A1、SLC7A2、SLC7A3、SLC7A4) 
异二聚氨基酸转运蛋白的糖蛋白相关/轻或催化亚基 (SLC7A5、SLC7A6、SLC7A7、SLC798、SLCA10 SLC7A13, SLC7A14) 
Na+/Ca2+ 交换剂(SLC8A1, SLC8A2, SLC8A3) 
Na+/H+ 交换剂(SLC9A1, SLC9A2, SLC9A3, SLC9A4, SLC9A5, SLC9A6, SLC9A7, SLC9A8, SLC9B 钠盐, SLC910, SLC9B 转移盐) (SLC10A1,SLC10A2,SLC10A3,SLC10A4,SLC10A5,SLC10A6,SLC10A7)
质子耦合金属离子转运体(SLC11A1,SLC11A2)
电中性的阳离子Cl协同转运体(SLC12A1,SLC12A1,SLC12A2,SLC12A3,SLC12A4,SLC12A5,SLC12A6,SLC12A7,SLC12A8,SLC12A9 ) 
Na+-硫酸盐/羧酸盐协同转运蛋白(SLC13A1, SLC13A2, SLC13A3, SLC13A4, SLC13A5) 
尿素转运蛋白(SLC14A1,SLC14A2)
质子肽转运蛋白(SLC15A1,SLC15A2,SLC15A3,SLC15A4)
单羧酸转运(SLC16A1,SLC16A2,SLC16A3,SLC16A4,SLC16A5,SLC16A6,SLC16A7,SLC16A8,SLC16A9,SLC16A10,SLC16A11,SLC16A12,SLC16A13,SLC16A14)
囊泡谷氨酸转运(SLC17A1 , SLC17A2, SLC17A3, SLC17A4, SLC17A5, SLC17A6, SLC17A7, SLC17A8, SLC17A9) 
囊泡胺转运蛋白(SLC18A1, SLC18A2, SLC18A3) 
叶酸/硫胺素转运, SLC219SLC2A+磷酸钠,SLC019SLC19SLC19SLC19SLC19S 转运阴离子转运亚科 1 (SLCO1A2, SLCO1B1, SLCO1B3, SLCO1C1) 亚科 2 (SLCO2A1, SLCO2B1) 亚科 3 (SLCO3A1) 亚科 4 (SLCO4A1, SLCO4C1) 亚科 5 (SLCO5A1 (SLCO2A1) 亚科 5 (SLCO5A1) (SLCO2A1) 
亚族转运离子 / 亚族 2 离子/A2 离子, SLC22A2, SLC22A3, SLC22A4, SLC22A5, SLC22A6, SLC22A7, SLC22A8, SLC22A9, SLC22A10,SLC22A11,SLC22A12,SLC22A13,SLC22A14,SLC22A15,SLC22A16,Slc22a17等,SLC22A18,SLC22A18AS,SLC22A19,SLC22A20,SLC22A23,SLC22A24,SLC22A25,SLC22A31)
Na +依赖性抗坏血酸转运体(SLC23A1,SLC23A2,SLC23A3,SLC23A4)
Na + /(钙+ - K+) 交换器(SLC24A1, SLC24A2, SLC24A3, SLC24A4, SLC24A5, SLC24A6) 
线粒体载体(SLC25A1, SLC25A2, SLC25A3, SLC25A4, SLC25A5, SLC25A6, SLCC5SLCA2, SLCC5SLCA2, SLCA5, SLCCPA6, SLCC5SLCA5 SLC25A12,SLC25A13,SLC25A14,SLC25A15,SLC25A16,SLC25A17,SLC25A18,SLC25A19,SLC25A20,SLC25A21,SLC25A22,SLC25A23,SLC25A24,SLC25A25,SLC25A26,SLC25A27,SLC25A28,SLC25A29,SLC25A30,SLC25A31,SLC25A32,SLC25A33,SLC25A34,SLC25A35,SLC25A36, SLC25A37, SLC25A38, SLC25A39, SLC25A40, SLC25A41, SLC25A42, SLC25A43, SLC25A44, SLC25A45, SLC25A46), SLC25A47, SLC25A49SLC25(SLC25A48), MLC25A48SLC5SLC25A51,SLC25A52,SLC25A53
多官能阴离子交换剂(SLC26A1,SLC26A2,SLC26A3,SLC26A4,SLC26A5,SLC26A6,SLC26A7,SLC26A8,SLC26A9,SLC26A10,SLC26A11)
脂肪酸转运蛋白(SLC27A1,SLC27A2,SLC27A3,SLC27A4,SLC27A5,SLC27A6)
Na + - 耦合核苷转运(SLC28A1,SLC28A2,SLC28A3)
便利核苷转运(SLC29A1,SLC29A2,SLC29A3,SLC29A4)
锌转运(SLC30A1,SLC30A2,SLC30A3,SLC30A4,SLC30A5,SLC30A6,SLC30A7,SLC30A8,SLC30A9,SLC30A10)
铜转运体(SLC31A1, SLC31A2) 
囊泡抑制性氨基酸转运蛋白 (SLC32A1) 
乙酰辅酶 A 转运蛋白 (SLC33A1) 
II 型 Na+-磷酸盐协同转运蛋白 (SLC34A1, SLC34A2, SLC34A3) 
核苷酸-糖转运蛋白亚家族 A (SLC35A1, SLC35A2A, SLC35A2A, SLC35A2 , SLC35B2, SLC35B3, SLC35B4) 亚族 C (SLC35C1, SLC35C2) 亚族 D (SLC35D1,SLC35D2, SLC35D3) 亚族 E (SLC35E1, SLC35E2A, SLC35E2B, SLC35E3, SLC35E4) 亚族 F (SLC35F1, SLC35F2, SLC35F3, SLC35F4, SLC35F5, SLC35G5, SLC35G5, 亚族转运 SLC35G5, SLC35G5, SLC35G5, SLC35G5, 亚族 GLC35 SLC36A1, SLC36A2, SLC36A3, SLC36A4) 
糖-磷酸/磷酸交换剂(SLC37A1, SLC37A2, SLC37A3, SLC37A4) 
System A & N, 钠偶联中性氨基酸转运蛋白(SLC38A1, SLC38A2, SLC38A2, SLC37A2, SLC37A4, SLC38A4) SLC38A8,SLC38A9,SLC38A10,SLC38A11)
金属离子转运体(SLC39A1,SLC39A2,SLC39A3,SLC39A4,SLC39A5,SLC39A6,SLC39A7,SLC39A8,SLC39A9,SLC39A10,SLC39A11,SLC39A12,SLC39A13,SLC39A14)
基底铁转运蛋白(SLC40A1)
MgtE状镁转运蛋白 (SLC41A1, SLC41A2, SLC41A3) 
氨转运蛋白 (RHAG(SLC42A1), RHBG(SLC42A2), RHCG(SLC42A3)) 
Na+-独立,system-L 样氨基酸转运蛋白 (SLC43A1, SLC43A2, SLC43A3) 
胆碱样转运蛋白 (SLC44A1, SLC44A2, SLC44A3, SLC44A4, SLC44A5) 
假定的糖转运蛋白 (SLC45A1, SLC45A2, SLC46A3), SLC46A3, SLC46A3多药和毒素挤出(SLC47A1、SLC47A2) 
血红素转运蛋白家族(SLC48A1) 
血红素转运蛋白(FLVCR1(SLC49A1)、FLVCR2(SLC49A2)、SLC49A3、SLC49A4) 
SWEET 家族的糖流出转运蛋白(SLC50A 衍生分子的 SLC1A 类固醇转运蛋白) , SLC51B) 
核黄素转运蛋白家族 RFVT/SLC52 (SLC52A1, SLC52A2, SLC52A3) 
磷酸盐载体 (XPR1(SLC53A1) 
线粒体丙酮酸载体 (MPC1(SLC54A1), MPC2(SLC54A2), MPC2(SLC51A2)(SLC52A2), MLC52(SLC54A2)
3L阳离子交换器SLC54A1), LETM2(SLC54A2), LETMD1(SLC54A3)) Sideroflexins (SFXN1(SLC56A1), SFXN2(SLC56A2), SFXN3(SLC56A3),SFXN4(SLC56A4), SFXN5(SLC56A5)) 
NiPA 样镁转运蛋白家族 (NIPA1(SLC57A1), NIPA2(SLC57A2), NIPAL1(SLC57A3), NIPAL2(SLC57A4), NIPAL3(SLC57A4)-Mag)
镁转运蛋白家族 (MAGT1(SLC58A1), TUSC3(SLC58A2)) 
葡萄糖转运蛋白 (MFSD4A(SLC60A1)(SLC60A1)(SLC58A2), 
2MFSD0A转运蛋白家族SLC61A1)) 
高尔基体 Ca2+/H+ 交换器 (TMEM165(SLC63A1)(SLC64A1) 
胆固醇SLC65A1), NPC1L1(SLC65A2)) 
焦磷酸盐转运蛋白 (ANKH(SLC62A1)),SP59NSA1S3S1phings1phingers (SLC63A2)、SPNS3(SLC63A3)) 
NPC 型胆固醇转运蛋白 (NPC1(SLC65A1)、NPC1L1(SLC65A2)) 
阳离子氨基酸输出蛋白 (SLC66A1、SLC6S6S6S6S6A6A1) ), MPDU(SLC66A5))NIPA2(SLC57A2), NIPAL1(SLC57A3), NIPAL2(SLC57A4), NIPAL3(SLC57A5), NIPAL4(SLC57A6)) 
MagT 样镁转运蛋白家族 (MAGT1(SLC58A1), TUSC3(SLC57A4) (SLC59A1), MFSD2B(SLC59A2)) 
葡萄糖转运蛋白 (MFSD4A(SLC60A1), MFSD4B(SLC60A2)) 
钼酸盐转运蛋白家族 (MFSD5(SLC61A1)) 
阳离子氨基酸输出蛋白 (SLC66A1、SLC6S6S6S6S6A6A1) ), MPDU(SLC66A5))TUSC3(SLC58A2)) 
钠依赖性溶血磷脂酰胆碱同向转运蛋白家族 (MFSD2A(SLC59A1), MFSD2B(SLC59A2)) 
葡萄糖转运蛋白 (MFSD4A(SLC60A1), MFSD4B(SLC60A2)) 
(磷酸钼酸盐转运蛋白) (MFSD2A(SLC59A1), MFSD2B(SLC59A2)) )) 
鞘氨醇磷酸转运蛋白 (SPNS1(SLC63A1)、SPNS2(SLC63A2)、SPNS3(SLC63A3)) 

假定的 SLC 编辑本段

推定的 SLC,也称为非典型 SLC,是新颖的、似是而非的次级活性或促进性转运蛋白,与已知的 SLC 共享祖先背景。然而,MFS 类型的非典型 SLC 可以细分为 15 个推定的 MFS 转运蛋白家族 (AMTF)。所有推定的 SLC 都是合理的 SLC 转运蛋白。有些只是在命名时是“非典型的”;基因具有 SLC 分配但作为别名,并保留其已分配的“非 SLC”基因符号作为批准的符号。这里列出了一些推定的 SLC:OCA2、CLN3、TMEM104、SPNS1、SPNS2、SPNS3、SV2A、SV2B、SV2C、SVOP、SVOPL、MFSD1、MFSD2A、MFSD2B、MFSD3、MFSD4A、MFSD4B、SDSDMFSD6MF6MFSD5MF 、MFSD10、MFSD11、MFSD12、MFSD13A、MFSD14A、MFSD14B、UNC93A 和 UNC93B1。

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